评测五:临床诊断编码任务

1. 任务简介
  疾病分类与手术操作分类编码是对患者疾病诊断和治疗信息的加工过程,是病案信息管理的重要环节。病案编码已成为医院科学化、信息化管理的重要依据之一,它在评估医疗质量与医疗效率、设计临床路径方案、重点学科评价、医院评审、疾病诊断分级、传染病报告、医疗付款、合理用药监测等方面的应用越来越广泛、越来越深入。
  在诸多的分类方案中,最有影响力且在世界上最为普及的当数国际疾病分类(International Classification of Diseases,ICD)。ICD是WHO制定的国际统一的疾病分类方法,是目前国际上通用的疾病分类方法。中国也推出了疾病分类与代码国家临床版2.0和手术操作分类代码国家临床版2.0,在部分医院中得到了应用。

2. 任务详情
  本次评测任务主要目标是针对中文电子病历中进行诊断编码。给定一次就诊的相关诊断信息(包括入院诊断、术前诊断、术后诊断、出院诊断),以及手术名称、药品名称、医嘱名称,要求给出其对应的国家临床版2.0标准词。所有就诊数据均来自于真实医疗数据,并以《疾病分类与代码国家临床版2.0》词表为标准进行了标注。样例如下:
 其中“target”为编码,多个编码之间使用“;”分开
出院诊断 手术名称 术前诊断 术后诊断 入院诊断 药品名称 医嘱 target
右肾癌 pt2an0m0 高血压 经腹右肾部分切除术+使用人工智能辅助治疗加收(si) 左 右 双肾肾肿瘤 右肾癌 高甘油三酯血症 高尿酸血症 高血压 ω-3鱼油脂肪乳 丙氨酰谷氨酰胺 乳果糖 地西泮 塞来昔布。。。 "3m透气型透明敷料(固定导管)9546hp.10*11.5cm. x线计算机体层(ct)扫描加收(使用螺旋扫描) 一次性使用吸氧管ot-mi-100型.小号.(零感) 。。。 肾恶性肿瘤;原发性高血压
食管胃结合部癌 pt4an3bm1 iv期 腹腔镜辅助贲门癌根治术(贲门癌切除+d2淋巴结切除+食管空肠r-y吻合)+肝脏结节切除术 食管胃结合部肿物伴消化道出血 食管胃结合部肿物伴消化道出血 重度贫血 食管胃结合部癌 ct3n2m0 ω-3鱼油脂肪乳 丙氨酰谷氨酰胺 中/长链脂肪乳(c8-24) 呋塞米 地西泮 。。。 "(可来福)输液接头||01c-c3300(可来福):100个/盒 3m透明敷料(固定导管)(明尼苏达)||1679.10*11.5cm 3m透气型透明敷料(固定导管)9546hp.10*11.5cm. cvc护理 一体式吸氧管(舒氧宝)ty-xyg-22(宁波天益) 。。。 食管胃连接处恶性肿瘤;胃淋巴结继发恶性肿瘤

3. 评测方案
 (1)比赛以准确率(accuracy)作为最终评估标准。本任务中,准确率定义:给出正确的(诊断+手术+药品+医嘱)加诊断标准词的组合/待预测(诊断+手术+药品+医嘱)的总数。
 (2)训练数据2700条,测试数据337条。
 (3)以文件形式提交测试集的预测结果,约定如下:
  a)文件名:prediction.txt
  b)每行一条记录,记录格式:出院诊断\t手术名称\t术前诊断\t术后诊断\t入院诊断\t药品名称\t医嘱名称\t标准词 \n,注意标准词有多个值时,用;分隔,例如:标准词1;标准词2
  c)记录顺序与测试集保持一致

4. 参赛规则
注意,以下通用规则适用于本评测任务。在此基础上,参赛选手还需遵循具体大赛的特有规则。如有冲突,以后者为准。
 1.参赛选手需要提交“参赛队名,队长信息(姓名,邮箱,联系电话),参赛单位名称”等信息,报名方式见下文。
 2.报名截止到测试数据集发布,在测试数据集发布之后,未报名的选手/队伍不能再报名或提交。
 3.每支队伍需指定一名队长,队伍名称不超过15个字符,队伍成员不超过4人。
 4.每名选手只能参加一支队伍,一旦发现某选手以注册多个账号的方式参加多支队伍,将取消所有相关队伍的参赛资格。
 5.允许使用公开和选手个人/组织内部的代码、工具、数据,但需要保证参赛结果可以复现。
 6.针对测试集,选手不允许执行任何人工标注。
 7.参赛选手最终需要提交可运行的代码和方法描述文档,若在排行榜上的结果无法复现,将取消参赛资格。
 8.欢迎国内外在校生及社会在职人士参加。比赛组织方成员不可参赛。

5. 报名方式
 1.下载 《数据使用与保密承诺书》 在文档末尾填写参赛队伍信息。
 2.参赛队负责人签名(手写签名);
 3.将签名的《数据使用与保密承诺书》扫描件(pdf)发送至以下邮箱 bo.kang@yiducloud.cn ,邮件标题为:参赛队名+“临床诊断编码任务数据使用申请”。

6. 时间安排
  • 报名时间:2022年6月1日-10月15日
  • 训练及验证数据发布:2022年7月5日
  • 测试数据发布:2022年9月26日
  • 提交测试结果:2022年9月30日
  • 评测论文提交时间:2022年10月(CHIP会议前一个月)
  • CHIP会议日期(评测报告及颁奖):2022年10月21-23日
  • 评测论文集中投稿:2023年1月-
  • 7. 任务组织者
     康波,医渡云(北京)技术有限公司, bo.kang@yiducloud.cn

    8. 评测主席
     汤步洲,哈尔滨工业大学(深圳),鹏城实验室, tangbuzhou@hit.edu.cn